4 缩略语 下列缩略语适用于本文件。 BSL-2:生物安全防护水平二级(Biosafety level-2) CPE:致细胞病变效应(Cytopathic effect) EV:肠道病毒(Enterovirus) ITD:型内鉴定(Intratypic differentiation) L20B:表达人类脊髓灰质炎病毒受体的小鼠L细胞系(Mouse L cells expressing the human poliovirus receptor) NEV:非肠道病毒(Non enterovirus) NPEV:非脊髓灰质炎肠道病毒(Non-polio enterovirus) NSL:非脊髓灰质炎疫苗类似株(Non Sabin like) PV:脊髓灰质炎病毒(Poliovirus) PVn:Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型脊髓灰质炎病毒 RD:人横纹肌肉瘤细胞系(Rhabdomyosarcoma) SL:脊髓灰质炎疫苗类似株(Sabin like) SLn:Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型脊髓灰质炎疫苗类似株 VDPV:疫苗衍生脊髓灰质炎病毒(Vaccine derived poliovirus) VDPVn:Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒 WPV:脊髓灰质炎野病毒(Wild poliovirus) WPVn:Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型脊髓灰质炎野病毒
5 WPV 和 VDPV 鉴定流程 5.1 WPV 和 VDPV 鉴定流程图 粪便标本是脊髓灰质炎病毒鉴定最常用的标本类型,本文件以粪便标本为例说明WPV和VDPV鉴定流程,其他类型的标本可参照执行。粪便标本的WPV和VDPV鉴定流程如图1所示。 5.2 实验室生物安全 根据《人间传染的病原微生物目录》(国卫科教发〔2023〕24 号)规定,鉴定流程中的所有操作应在 BSL-2 实验室进行。经此流程鉴定出的脊髓灰质炎野病毒和Ⅱ型脊髓灰质炎病毒的病毒分离物操作应在 BSL-3 条件下进行,Ⅰ型和Ⅲ型脊髓灰质炎疫苗株和 VDPV 的病毒分离物应在 BSL-2 条件下进行。实验室生物安全要求应符合 GB 19489 和 WS 233 的规定。 图 1 WPV 和 VDPV 鉴定流程图
6 WPV 和 VDPV 鉴定步骤 6.1 标本的采集和运输 采集粪便标本用于脊髓灰质炎病毒分离,每份标本质量大于或等于5 g(约为成人的大拇指末节大小),装入一次性采便管或采便盒中。根据WS/T 852和《人间传染的病原微生物目录》的规定,应按照UN 3373(B类感染性物质)的要求,采用B类包装对标本进行冷藏运输。 6.2 标本的处理 粪便标本在进行病毒分离之前应进行处理,具体操作按附录A。 6.3 病毒分离 处理后的粪便悬液应同时接种到L20B和RD两种细胞系上。病毒分离具体操作及L20B和RD两种细胞系的检测按WS 294的规定。 6.4 ITD 筛选 ITD包括前后两个rRT-PCR实验,分别为ITD rRT-PCR和VDPV rRT-PCR。首先对L20B阳性分离物进行ITD rRT-PCR,鉴定脊髓灰质炎病毒和其血清型别,同时筛选疑似的WPV。随后进行VDPV rRT-PCR,筛选疑似的VDPV。ITD的具体操作按附录B。 6.5 VP1 区核苷酸序列测定 对ITD筛选到的疑似WPV或VDPV进行完整的VP1区(Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型脊髓灰质炎病毒VP1区域长度分别为906nt、903nt和900nt)核苷酸序列测定,该方法是鉴定WPV和VDPV的金标准方法。根据WS 294规定,粪便标本进行病毒分离时,传代次数≤5次,随即进行VP1区核苷酸序列测定,防止病毒在扩增过程中产生随机突变位点。对单一血清型的脊髓灰质炎病毒VP1区核苷酸序列测定的具体操作按附录C。 6.6 序列比对鉴定 WPV 和 VDPV 采用生物信息学软件对比样品与Sabin株的VP1区核苷酸序列,按照下述标准鉴定WPV、VDPV和SL。 ——属于血清型Ⅰ型且与 Sabin1 的核苷酸变异率≥15 %(≥136 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为WPV1。 ——属于血清型Ⅰ型且与 Sabin1 的核苷酸变异率>1 %(≥10 个 nt 差异)且<15 %(≤135 个 nt差异)的脊髓灰质炎病毒为 VDPV1。 ——属于血清型Ⅰ型且与 Sabin1 的核苷酸变异率≤1 %(≤9 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为 SL1。 ——属于血清型Ⅱ型且与 Sabin2 的核苷酸变异率≥15 %(≥136 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为WPV2。 ——属于血清型Ⅱ型且与 Sabin2 的核苷酸变异率>0.6 %(≥6 个 nt 差异)且<15 %(≤135 个 nt差异)的脊髓灰质炎病毒为 VDPV2。 ——属于血清型Ⅱ型且与 Sabin2 的核苷酸变异率≤0.6 %(≤5 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为 SL2。 ——属于血清型Ⅲ型且与 Sabin3 的核苷酸变异率≥15 %(≥135 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为WPV3。 ——属于血清型Ⅲ型且与 Sabin3 的核苷酸变异率>1 %(≥10 个 nt 差异)且<15 %(<135 个 nt差异)的脊髓灰质炎病毒为 VDPV3。 ——属于血清型Ⅲ型且与 Sabin3 的核苷酸变异率≤1 %(≤9 个 nt 差异)的脊髓灰质炎病毒为 SL3。 |