流行性出血热诊断标准(WS 278—2026)

2026-8-17 21:21| 发布者: 国正行| 查看: 48| 评论: 0

摘要: 本标准规定了流行性出血热的诊断依据、诊断原则、诊断和鉴别诊断,适用于全国各级各类医疗卫生机构及其医务工作人员对流行性出血热的诊断、报告。 ... ... ... ...



附 录 B

(规范性)

流行性出血热病原学诊断方法

 

可采用逆转录聚合酶链式扩增(Reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)、实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(quantitative Real-time RT-PCR , qRT-PCR)、基因测序或其他经过评估合格的病毒基因组核酸检测方法进行检测,检出特异性病毒核酸具有确诊意义。

B.1 流行性出血热病毒RT-PCR法核酸检测

B.1.1 原理

PCR技术是在特异性引物存在的条件下,利用双链DNA分子碱基配对原则,在体外扩增DNA片段,其特异性取决于寡核苷酸引物的序列。引物与待扩增片段两条链两段DNA序列分别互补结合后,在DNA聚合酶催化下,引导引物的5′端向3′端方向延伸合成新链,是温度控制下可重复进行的热变性、复性延伸的温控循环过程,可使DNA产量呈指数上升。汉坦病毒为负链RNA病毒,PCR扩增检测前需经过逆转录酶作用,合成第一条cDNA链,再进行PCR扩增,即RT-PCR。设计不同特异性引物可扩增不同种汉坦病毒基因。从患者标本中提取病毒基因组RNA,利用适当方法进行核酸检测,可通过扩增片段大小鉴定、基因组序列比对分析、特异性引物探针序列等方式,达到病原体鉴定和基因分型目的。

B.1.2 实验材料

材料与试剂如下,可根据所选用试剂盒的不同有所增减:

a) 急性期患者血标本或分离的汉坦病毒;

b) RNA提取试剂盒;

c) 汉坦病毒核酸扩增引物及分型引物(表B.1);

d) 逆转录与PCR扩增试剂盒;

e) 移液器(10 μL20 μL100 μL200 μL1000 μL)及配套吸头、PCR反应管、离心管(1.5mL)及管架、台式高速离心机、普通冰箱、旋涡混合器、PCR扩增仪等。

B.1 流行性出血热病毒RT-PCR法核酸检测及基因分型参考引物序列

引物名称

引物序列(5'3'

片段大小

型别

HantaMF

5’-GGACCTGGTGCCAGTTGTGAAGC-3’

490bp

通用

HantaMR

5’-ACCTCACAAACCATTGAACC-3’

HTNG1F

5’-TGCAACGGGCAGAGGAAAGT-3’

242bp

汉滩

HTNG1R

5’-GTACTGATTTTAGCCTATCTC-3’

SEOG1F

5’-TGTAATGGTCAGAAAAAGAC-3’

287bp

首尔

SEOG1R

5’-CGTAGAATGGCTTTGAATCGGTT-3’

 

B.1.3 实验步骤

应参照所选用试剂盒说明书进行相关检测,参考步骤如下。

a) 病毒RNA的提取:按试剂说明书操作,制备模板RNA

b) 逆转录合成cDNA:可用随机引物或病毒特异性引物,按商业化逆转录酶说明书进行。

c) PCR扩增: 根据实验室内所使用病毒核酸PCR扩增试剂盒特点,通用型正、反向引物配置第一轮PCR体系,进行第一轮PCR扩增。推荐反应条件为94℃预变性2 min,然后94℃变性30 s55℃退火30s72℃延伸1 min,反应40循环,最后72℃延伸10 min。第二轮分型PCR扩增体系配置采用分型正向引物与反向引物。推荐反应条件为94℃预变性2 min,然后94℃变性30 s55℃退火30 s 72℃延伸1 min,反应30循环,最后72℃延伸10 min

d) 电泳分析:1.5%浓度琼脂糖电泳分析,根据扩增条带大小确定病毒型别。若条带的分子量与预期片段大小相同,则表明为特异性扩增产物。

必要时,可进行:

e) PCR片段的回收和核苷酸序列测定:切下特异分子量条带,用凝胶电泳回收试剂盒回收纯化所扩增的DNA片段(按相应试剂盒说明书进行),测序仪测序。

B.1.4 意义

排除PCR污染后,扩增到特异性条带可确诊汉坦病毒感染,根据片段大小和序列测定可对汉坦病毒进行分型,阴性结果不能排除诊断。

 

B.2 流行性出血热病毒qRT-PCR法核酸检测

B.2.1 原理

在我国,流行性出血热主要由姬鼠型(汉滩型)和家鼠型(首尔型)汉坦病毒引起,根据病毒基因组序列特征,设计特异性引物和特异性荧光标记核酸探针,可快速实现病毒分型检测。探针结合部位位于引物结合区域内,其5’端和3’端可分别标记不同的荧光素,称为报告荧光基团(用R表示)和淬灭荧光基团(用Q表示,淬灭荧光基团也可用小沟结合物MGB)。当引物和探针同时与目的基因片段结合时,探针R基团发出的荧光信号被Q基团所吸收,仪器检测不到R所发出的荧光信号;当PCR扩增延伸到探针结合部位时,Taq酶发挥5’→3’外切核酸酶的功能,将探针水解成单核苷酸,探针上的R基团游离释放,所发出的荧光不再为Q基团所淬灭,可被检测仪接收识别,随着PCR循环扩增反应的延续,RQ基团游离于溶液中的量不断增加,仪器可继续检测到R所发出的荧光信号。qRT-PCR可定性或定量检测标本中的病毒核酸。

B.2.2 实验材料

材料与试剂如下,可根据所选用试剂盒的不同有所增减:

a) 急性期患者血标本或分离的汉坦病毒;

b) RNA提取试剂盒;

c) 汉坦病毒核酸实时荧光RT-PCR扩增检测引物(表B.2),或其他流行性出血热实时荧光RT-PCR检测试剂盒;

d) 移液器(10 μL20 μL100 μL200 μL1000 μL)及配套吸头、PCR反应管、离心管(1.5mL)及管架、台式高速离心机、普通冰箱、旋涡混合器、实时荧光PCR仪等。

B.2 流行性出血热病毒实时荧光RT-PCR法核酸检测参考引物探针序列

病毒

引物/探针

序列(5'-3'

汉滩

F(771-793)

GCTTCTTCCAGATACAGCAGCAG

R(862-884)

GCCTTTGACTCCTTTGTCTCCAT

P(811-839)

FAM-CCTGCAACAAACAGGGAYTACTTACGGCA-BHQ1

首尔

F(217-237)

GATGAACTGAAGCGCCAACTT

R(272-291)

CCCTGTAGGATCCCGGTCTT

P(239-263)

HEX-CCGACAGGATTGCAGCAGGGAAGAA-BHQ1

 


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